一、项目概述
（刘翘铭、杨贝/文）探究肿瘤表型变化机制将有力推动肿瘤靶向治疗、抗肿瘤药物研发、患者病程评估等方面发展。随着单细胞、时空转录组测序的进步，在时空视角下从基因调控层面挖掘表型关键基因、识别肿瘤表型相关细胞及空间域成为研究肿瘤表型异质性的重要路径。
本项目提出单细胞时空转录组数据的肿瘤表型相关细胞及空间域识别方法：首先以带有肿瘤表型信息的RNA-seq数据为基础，识别肿瘤表型关键作用基因；然后以组织水平关键基因与肿瘤表型间调控互作关系为先验知识，结合肿瘤scRNA-seq数据，构建肿瘤表型相关细胞亚型识别模型；最后根据细胞亚型与肿瘤表型间映射关系，开发肿瘤表型相关细胞及空间域识别算法，填补空间域识别算法在肿瘤表型异质性研究领域的技术空白。
本项目为青年科学基金项目。
二、项目负责人简介
刘翘铭，哈尔滨工业大学工学博士，现任哈工大郑州研究院博士后研究员，中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员，主要研究工作涉及单细胞测序数据分析系统的设计与研发、家禽动物单细胞转录组数据图谱构建等内容。发表SCI论文15篇，其中以第一或通讯作者在Briefings in Bioinformatics、IEEE JHBI、IEEE TCBB、IEEE BIBM等生物信息学顶级期刊或会议发表论文6篇，担任《Bioinformatics》、《Briefings in Bioinformatics》、《Frontiers in Genetics》、《BMC Bioinformatics》、《PLOS Computational Biology》等生物信息学期刊审稿人。博士后在站期间主持国家自然科学基金青年项目1项、中国博士后基金面上项目1项、河南省自然基金青年项目1项，入选2023年度国家博士后资助计划，并先后参与国自然杰出青年、国自然面上、国家重点研发计划等项目5项。
三、联系方式
如您对本项目及研究方向感兴趣，并有意展开相关合作，可联系付老师 0371-61680824沟通具体事宜。
责任编辑：梅鹏飞
审核：张懿文
